2020年12月30日，交通運輸部南海航海保障中心港珠澳大橋航標處正式揭牌成立。此舉將為過往船舶提供更優質的導助航服務，提升船舶遇險應急處置能力，保障大橋及附近水域水上交通運輸安全暢通，更好服務粵港澳大灣區經濟社會發展。

港珠澳大橋航標處主要承擔大橋主體工程附近水域及轄區航標建設養護、航海保障技術支持及服務保障工作，下設橋區、高欄、桂山、三灶4個航標管理站，轄區覆蓋西起小襟島、東至擔桿頭沿海120海里，南起珠江口、北至淇澳島縱深50海里沿海水域，負責管理各類航標448座。

據悉，自2009年港珠澳大橋開工建設以來，南海航海保障中心共設置調整航標1290座次，發布水域航標動態175份;開展掃海測量37項，掃測面積達324.5平方公里，繪制專題圖56幅，印制12余萬份。2019年，港珠澳大橋157座專用航標全部轉為公用航標收歸交通運輸部管理;2020年10月，大橋水域公用航標全部采用北斗終端遠程管理，北斗覆蓋率達100%。

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